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“大学堂”顶尖学者讲学计划 | 芝加哥丰田计算技术研究所许锦波教授讲座预告

应北京大学“大学堂”顶尖学者讲学计划的邀请,芝加哥丰田计算技术研究所许锦波教授于2021年10月访问北京大学,并发表演讲。

讲座安排

题目:Artificial Intelligence and Protein Folding(人工智能与蛋白质折叠)

时间:2021年10月27日(星期三)14:00-15:30

地点:北京大学第二体育馆燕京学堂报告厅(B101)

主持人:谢晓亮教授

讲座摘要

Accurate description of protein structure and function is a fundamental step towards understanding biological life and highly relevant in the development of therapeutics. Although greatly improved, experimental protein structure determination is still low-throughput and costly, especially for membrane proteins. Computational methods have the potential to solve protein structures faster than wet-lab techniques, but computationally predicting the structure of a protein from its amino acid sequence is very challenging and usually needs a large amount of computing power. This talk will present modern artificial intelligence (AI) methods (i.e., deep convolutional residual neural network and Transformers) that have revolutionized protein structure prediction, showing that even with only a personal computer AI may predict the structure of a protein much more accurately than ever before.

准确描述蛋白质结构和功能是理解生命过程的基础,并深深影响药物疗法的发展。虽然已经历了深入发展,但通过实验手段实现对蛋白质结构的测定尤其是膜蛋白的测定,依然存在通量不足、费用昂贵等问题。相比于湿实验,干试验如计算方法具有速度更快等潜力,但从氨基酸序列预测蛋白质的结构难度很大,通常需要大量的计算资源。本讲座将介绍现代人工智能(AI)方法(例如深度卷积残差神经网络与Transformers)是如何革命性地实现蛋白质结构预测的,并展示仅仅利用一台个人电脑,AI就可能实现以往远未达到的蛋白质结构预测精度。

许锦波介绍

许锦波出生于1974年,1996年本科毕业于中国科学技术大学,1999年在中国科学院计算机研究所获得硕士学位,2003年获得加拿大滑铁卢大学博士学位,2004年—2005年在美国麻省理工学院数学系从事博士后研究,2005年到芝加哥丰田计算技术研究所工作至今。

许锦波致力于人工智能预测蛋白质结构研究,研发出久负盛名的蛋白质结构预测软件RaptorX和蛋白质相互作用网络分析软件IsoRank等生物信息学软件,获得了美国斯隆研究奖、美国自然科学基金早期职业奖、《PLoS Computational Biology》创新突破奖、国际计算生物学顶级会议RECOMB最佳论文奖和时间检验奖(Test-of-Time Award)等众多奖项。他发明的机器学习算法将蛋白质结构预测的问题提升了一个新台阶。2016年他首次证明深度学习能大幅度提高蛋白质结构预测的性能(PLoS Computational Biology 2017),实现了人工智能在蛋白质结构预测领域的突破。2020 年,人工智能预测蛋白质结构被《科学》杂志评为十大科学突破之一。

线上直播:

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主办单位:华体会官网入口 - 华体会网页登录入口 - 华体会app官网登录

承办单位:北京大学生物医学前沿创新中心(BIOPIC)、北京大学国际合作部

赞助单位:光华教育基金会、北京大学教育基金会

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